Des levures peuvent se trouver parmi les germes viables à 20°C, ou à 37°C, avec les bactéries, leurs colonies ayant même aspect. Un comptage des levures sans bactéries peut se faire sur un milieu de culture gélosé avec antibiotiques. On a alors les levures (colonies de type bactérien) et les moisissures (colonies duveteuses) (code Sandre n°1067). Les levures sont un indicateur de contamination aérienne.