Le protocole test d’échantillonnage de la faune macroinvertébré littorale lacustre doit permettre d’étudier les relations pressions hydromorphologiques/peuplements tels que le marnage non intrinsèque, les modifications morphologiques des berges et/ou les perturbations physiques, morphologiques et chimiques des habitats littoraux. La méthode présentée a été développée pour un usage en France métropolitaine. Cependant, son application est possible sur d'autres territoires présentant les mêmes types de masse d’eau à condition que les connaissances sur la faune macroinvertébré soient assez avancées. Le but du présent guide est de synthétiser tous les éléments nécessaires au calcul de l’IML et à son expression en « Ecological Quality Ratio » (EQR) pour l’évaluation de l’état écologique au sens de la Directive-cadre sur l’eau (DCE) des plans d’eau naturels et le Potentiel Ecologique des lacs artificiels. Pour tous les lacs Naturels (LN) quelque soit leur marnage, et les lacs d’artificiels (LA) dont le marnage maximal est inférieur ou égal à 2m, leur Etat Ecologique (pour LN) ou Potentiel Ecologique (pour LA) seront évalués par le calcul de l’IMLE-PE (Etat -Potentiel Ecologique). Pour les LA dont le marnage maximal est supérieur à 2m, leur Potentiel Ecologique sera évalué par le calcul de l’IMLPE. Ce guide comprend les phases d’élaboration du plan d’échantillonnage, de prélèvements sur le terrain, le travail de laboratoire ainsi que les phases ultérieures de calculs d’indices. Ce présent guide est accompagné d’un second document regroupant les différentes annexes.