Deux autres paramètres SANDRE existent pour le PFNA (le code [9596] pour la forme linéaire et le code [9597] pour les formes ramifiées). Actuellement le paramètre [9596] ne doit pas être utilisé dans la plupart des programmes de surveillance règlementaire sur les matrices « eau ». Le paramètre recommandé est le paramètre 6508 [Acide perfluoro-nonanoique (PFNA / formes linéaires et ramifiées)] qui correspond à l'ensemble des formes linéaires et ramifiées de l’acide perfluorononanoique. Il répond actuellement à la plupart des règlementations dans le domaine de l'eau (sommes des formes linéaires et ramifiées). Il est associé au code CAS 375-95-1 pour assurer une cohérence règlementaire (ce numéro CAS est mentionné dans les principales directives européennes liées à l'eau). Cependant ce code CAS fait uniquement référence à la forme linéaire. Dans certains contextes particuliers, l'analyse séparée des formes linéaires et ramifiées peut être nécessaire ou demandée. Les codes [9596] (PFNA (forme linéaire)) et [9597] (PFNA (formes ramifiées)) ont été créés pour y répondre. Afin d’éviter des confusions, le code CAS 375-95-1 n’est mentionné qu’en commentaire pour le paramètre [9596]. Dans le domaine règlementaire des eaux destinées à la consommation humaine la commission européenne a indiqué, que pour les 20 PFAS de la directive étaient considérés comme incluant les isomères linéaires et ramifiés (C/2024/4910). Concernant la quantification des formes ramifiées, peu d’étalons analytiques existent et par ailleurs les formes ramifiées peuvent être nombreuses. La plupart des recommandations analytiques actuelles (notamment celles de la norme NF EN 17892) sont de quantifier les formes ramifiées en utilisant l’étalon analytique de la forme linéaire.