L’objectif de la "surveillance écologique et halieutique des CNPE de bord de mer et d'estuaire" est de suivre l’évolution à moyen / long terme des différents domaines marins (pelagos, benthos et halieutique) et leurs compartiments associés (hydrologie, physico-chimie, chimie, phytoplancton, zooplancton, microbiologie, zoobenthos, phytobenthos, ichtyoplancton, etc…). Cette surveillance est mise en oeuvre à une échelle locale (proche des CNPE et de leur zone d’influence) dans le but de déceler des écarts à l'évolution naturelle du milieu récepteur à travers le suivi de quelques paramètres caractéristiques de chaque compartiment. La zone d’études peut s’étendre au niveau régional, si les paramètres surveillés ont une distribution régionale, comme dans le cas de l’halieutique. Le programme IGA-PELA-PHYT regroupe l'ensemble des données de surveillance réglementaire des caractéristiques du domaine PHYTOPLANCTONIQUE (Biomasse, flores, production primaire) sur les abords des 5 CNPE de bord de mer et d'estuaire depuis le milieu des années 1980.